تتولى الأمانة العامة لبرنامج ضيوف خادم الحرمين الشريفين للحج والعمرة التنفيذ والإشراف على ثلاثة برامج استضافة هي كالتالي:
1. برنامج ضيوف خادم الحرمين الشريفين للحج (البرنامج العام).
2. برنامج ضيوف خادم الحرمين الشريفين للحجاج ذوي شهداء فلسطين.
3. برنامج ضيوف خادم الحرمين الشريفين للعمرة والزيارة.
4. ما تُكلف به الوزارة من استضافات وبرامج أخرى.